DDD

El grup de recerca se sitemès dinàmics (GSD,) té un sistema propi de gestió de la producció científica. Hans instal·lat Aigaiaon, acoblat a Joomla. Recullen sistemàticament el preprints i els posen en obert/tancat segons decideix l'autor.
http://www.gsd.uab.cat/

Arran de les recomanacions per l'accés obert demanen com traspassar regularment el contingut al DDD. Es planteja un treball col·laboratiu per traspassar regularment les referències i els preprints.

Vaig parla amb l'informàtic que porta el DDD, Ferran Jorba, i em va insistir sobretot en que les dades de sortida fossin en .txt, un registre sota l'altre separtat per un espai. Aquest, i no CSV, és el que ens recomana per tal inconvenients. Així:

ID1
Camp1
Camp2
Camp3

ID2
Camp1
Camp2
Camp3
Camp4

ID3
Etc.

De momento, podríem agafar una mostra amb registres i pdf associats i fer una primera prova. A partir d'aquí caldrà pactar el procediment i la frequència de traspàs.

Tomàs,

un matís a tal com has escrit el meu suggeriment. Volia dir que prefereixo que la informació bibliogràfica estigui en un format de l'estil:

etiqueta: valor
etiqueta: valor

Així, si un camp existeix més d'un cop, es pot repetir, i si no existeix cap, no cal que aparegui. Per exemple:

num: 1
autor: Fagregat, Tomàs
autor: Jorba, Ferran
titol: Especificacions per a importar informació bibliogràfica
data: 2015

I també vaig insistir que es fes amb una freqüència alta, al menys d'un cop al mes, o un cop a la setmana, perquè així ens veiem obligats a automatitzar-ho. Fer-ho amb freqüències menors d'un mes són massa excepcionals i manuals, i depenen massa de la intervenció de les persones.

El traspàs de fitxers també s'hauria d'automatitzar, deixant-lo, per exemple, accessible via http des del DDD.

Ferran,

M'han demanat el següent. Com ho fem? Els pots donar un model?

"Hola, he parlat amb el nostre informatic i tenim clar que el problema principal per a pasar-vos les dades es l'ordre dels camps, ja que tal i com ho tenim ara hi ha articles, proceedings, llibres, capitols de llibres,... i per tant el nom dels camps i tipus no coincideix. I l'ordre es molt important. Em podries enviar un model de com ho voleu i aixi despres anem ja perfilant el que us enviarem?

Per exemple un article te:

Codi
DOI
Titol
Autors
Revista
ISSN
Volum
Numero
Any
Pagines
Abstract
keywords

Pero un article publicat en un llibre de proceedings o un capitol de llibre no te els mateixos camps, ja que no te Revista, ni issn, ...

Nosaltres tot ho tenim de forma que es pugui importar de l'estil bibtex del latex i per tant els noms dels camps poden dependre del tipus de publicacio.

http://en.wikipedia.org/wiki/BibTeX

Igual es pot fer servir alguna cosa automatica com http://www.xandi.eu/bib2x/

No se, com ho voleu?

Joan"

Tomas Fabregat va escriure:

Ferran,

M'han demanat el següent. Com ho fem? Els pots donar un model?

"Hola, he parlat amb el nostre informatic i tenim clar que el problema principal per a pasar-vos les dades es l'ordre dels camps, ja que tal i com ho tenim ara hi ha articles, proceedings, llibres, capitols de llibres,... i per tant el nom dels camps i tipus no coincideix. I l'ordre es molt important. Em podries enviar un model de com ho voleu i aixi despres anem ja perfilant el que us enviarem?

Segurament no m'he explicat prou bé: si etiqueten els camps (els de BibTeX ja em van bé), l'ordre és indiferent. És clar que per a cada tipus de registre hi ha camps que tenen sentit i altres no, cap problema. Pel que fa als camps amb més d'un autor (p. ex., més d'un autor), la solució més clara és repetir l'etiqueta cada cop davant de cadascun dels autors). Ara bé, si només ho poden fer amb un separador (ex., un punt i coma), també ho donaríem per bo. Això sí, seria molt important que l'ordre dels autors fos invers (Cognom, Nom), ja que no hi ha regles clares per convertir formes directes en indirectes (noms compostos, congoms compostos, dos cognoms, etc.).

Pròpiament, només ens calen aquells que tenen valor, però si no els hi és possible i sempre ens els han de donar tots, amb el contingut buit, no passaria res.

Perfecte!

Una pregunta: el seu identificador únic de registre, és aquest 'bibtexid'?

D'altra banda, ara mateix no tenim ben resolt al DDD la notació matemàtica. En principi Invenio ho suporta (ex: http://cds.cern.ch/record/2026272), però ara mateix nosaltres ho tenim deshabilitat perqyè coincideix amb la marca de subcamp $ de Marc21 (que al CERN dupliquen com a $$, i per això ells sí que ho tenen activat).

D'altra banda, jo continuo pensant que fer una acció dos cops a l'any és massa manual i, per tant, difícil d'automatitzar i, en conseqüència, massa propensa a errors humans.

Crec que és millor fer-ho un cop per setmana o, com a molt poc, un cop al mes. Així, tant ells com nosaltres ens veiem forçats a automatitzar el procés i no ens en descuidem.

Ferran Jorba va escriure:

D'altra banda, jo continuo pensant que fer una acció dos cops a l'any és massa manual i, per tant, difícil d'automatitzar i, en conseqüència, massa propensa a errors humans.

Crec que és millor fer-ho un cop per setmana o, com a molt poc, un cop al mes. Així, tant ells com nosaltres ens veiem forçats a automatitzar el procés i no ens en descuidem.

Bé, no crec que els suposi cap problema fer un rutina més freqüent. Ja els ho comenteré. Els que em preocupa és el tema de la notació matemàtica. Donava per descomptat que estava activat, venint com ve tot del CERN.

Ferran Jorba va escriure:

Perfecte!

Una pregunta: el seu identificador únic de registre, és aquest 'bibtexid'?

D'altra banda, ara mateix no tenim ben resolt al DDD la notació matemàtica. En principi Invenio ho suporta (ex: http://cds.cern.ch/record/2026272), però ara mateix nosaltres ho tenim deshabilitat perqyè coincideix amb la marca de subcamp $ de Marc21 (que al CERN dupliquen com a $$, i per això ells sí que ho tenen activat).

No l'identificador únic és: aigaionid: 4151

Ferranan,

Ja em diràs com col procedir. És el primer cop que faig aquest procés. Estic a la teva. Si puc tenir material carregat per treballar de cara al juliol millor que millor. Per nosaltres és un bon moment per treballar-hi.

Gràcies.

Tomàs,

ja anem bé. Si no em deixo res, cal pactar:

1. dades i format dels registres bibliogràfics (fet, llevat que ens surtin dubtes o similars).
2. procediment per automatitzar la trasferència dels seus registres nous al DDD.
3. decidir com tractar les (seves) correccions, si és que és una operació que fan gaire sovint, o fer-ho manualment (de moment, segurament seria més prudent)
4. pactar com recollim automàticament els seus PDFs i com els adjuntem als registres del DDD. De moment jo ho deixaria pel final.

fem una cosa, si et sembla: de moment que ens facin una extracció d'un mínim de 100 registres, o més si prefereixen, i els adjuntes a aquesta tasca, i en farem una càrrega de mostra al DDD de proves, i així podrem valorar i corregir el que calgui.

Ferran,

Per fer-ho fàcil, els demananaré els de 2013 i 2014.

Sobre els pdfs, me'ls pensaven passar a mi però com tu diguis. De moment ho deixem pel final.

T.

El fitxer que m'han enviat no té el format correcte. L'he demant de nou.

El que jo veig tot junt, qui m'ho envia ho veu així:

type: Article
aigaionid: 4191
bibtexid: CorCorLliMoe2015
title: Bifurcation of relative equilibria of the (1'3)-body problem
author: Corbera, Montserrat
author: Cors, Josep Maria
author: Llibre, Jaume
author: Moeckel, Richard
journal: SIAM Journal on Mathematical Analysis
year: 2015
volume: 47
number: 2
startpage: 1377
endpage: 1404
doi: 10.1137/140978661
keywords: (1 n)-body problem
keywords: Celestial Mechanics
keywords: relative equilibria
abstract: We study the relative equilibria of the limit case of the planar Newtonian 4-body problem when three masses tend to zero, the so-called (1 3)-body problem. Depending on the values of the infinitesimal masses the number of relative equilibria varies from ten to fourteen. Six of these relative equilibria are always convex, and the others are concave. Each convex relative equilibrium of the (1 3)-body problem can be continued to a unique family of relative equilibria of the general 4-body problem when three of the masses are sufficiently small and every convex relative equilibrium for these masses belongs to one of these six families.
file: CorCorLliMoe2015.Preprint.pdf

type: Article
aigaionid: 4183
bibtexid: CanFagGar2015
title: On a Family of Rational Perturbations of the Doubling Map
author: Canela, Jordi
author: Fagella, Nuria
author: Garijo, Antoni
journal: Journal of Difference Equations and Applications
year: 2015
doi: 10.1080/10236198.2015.1050387
keywords: Blaschke products
keywords: circle maps
keywords: Holomorphic dynamics
keywords: polynomial-like mappings
file: CanFagGar2015.preprint.pdf

Tomàs,

jo des de Linux el veig bé, cap problema. Windows és una mica miop, cap novetat al respecte ;-)

Ferran,

Com pots veure a sota, el grup GSD ja té preparat tota la informació prevista de carregar al DDD. Deixaríem pel setembre la càrrega del pdf. Els pdf m'els passarà en un zip. Va bé així? És millor que tel's enviï directament a tu?

Tomàs

mail de J. Torregrosa (28/7)

"Hola, practicament tinc ja tota la produccio cientifica del grup del
2011 al 2015.

Tambe estic mirant d'afegir automaticament a cada pdf els detalls de la publicacio. Tot i que igual preferiu fer-ho vosaltres. Per que ara els postprint que t'enviare no diu, dins, on s'han publicat. Pero ja he explicat al nostre informatic com s'ha de fer per a poder llegir el texte i inserir dins el pdf els detalls. Espero que ho podra fer pel setembre.

Quan vulguis et faig els fitxers de texte i el zip. Pero igual es millor esperar al setembre. Ja que aixi possiblement tindriem la informacio dins els pdf. Cosa que milloraria el ddd.

No m'has dit si el que et vaig enviar va anar be o no."

Ferran,

En pocs dies m'enviaran la primera remesa d'articles. Començarem per el 2015 i anirem fent el retrospectiu de forma progressiva. Cada tramesa constarà d'un fitxer txt amb els registres (tal com surt a #21) i d'un .zip amb els correponents pdfs. Respecte la forma d'enviar-ho, tens algun algun suggeriment? Vols rebre-ho tu directament o faig jo d'intermediari?

Només queda un serrell pendent de lligar. El grup manté i mantindrà la seva pròpia bbdd visible al web del grup (http://www.gsd.uab.cat/. Per evitar duplicitat, a mesura que tinguin les url del ddd la substituiran per la seves. Aquest procés és el que faran servir per marcar el ritme de les remeses. Per això demanen que després de cada remesa, un cop processada, de retorn puguin rebre un txt on cada registre tingui la URL del DDD. Un cop ells hagin subtituit els enllaços seus pels del DDD faran la següent remesa i així sucessivament.

Hi veus algun inconvenient?

Ritme de les remeses:

• 1a remesa: 2015
• Rutina annual: 2 remeses per any (70-80 articles)
• Remeses retrospectives per aquest ordre: 2014, 2013, 2012 i 2011. A ritme progressiu, segons es puguin anar absorbint i sempre previ retorn de la remesa prèvia amb les URL permaments del DDD. .

1 remesa entregada via correu-e, 18/11/15.

https://www.dropbox.com/sh/vz8s2rxvvkdtouu/AAArxds4TFFVh_rlRAjAxe2wa?dl=0

anys 2011-2015

Allotjada a: N:\BIBLIOTK\Suport recerca i docència\produccioCientifica\GSD_Torregrosa\remesa1Articles

Demano assessorament per automatitzar la capçalera

"Es per aixo que hem trigat tant.... teniem molt per enviar i fins que no hem corregit errors i els mecanismes no hem aconseguit enviar-t'ho.

Nosaltres el que hem fet es que el mateix script que extreu les dades de les taules de mysql genera el document que ha d'afegir-se. Ho fem amb latex aixo si, per que es la manera mes simple que hem trobat.

No veig cap impediment per ajudar-vos."