Projecte

General

Perfil

Accions

Tasca #6988

tancat
FJ FJ

Tractar les càrregues de PubMed com les recol·leccions OAI

Tasca #6988: Tractar les càrregues de PubMed com les recol·leccions OAI

Afegit per Ferran Jorba fa aproximadament 4 anys. Actualitzat fa aproximadament 1 any.

Estat:
Tancada
Prioritat:
Normal
Assignat a:
Categoria:
Gestió de la col·lecció
Temàtica prevista:
Inici:
07-03-2022
Data de venciment:
22-03-2024
Paraula clau:

Descripció

Les càrregues de PubMed funcionen d'aquesta manera:

Un dia la setmana (actualment diumenge a la tarda) es fan unes cerques a PubMed per trobar registres pressumptament de la UAB. Se'n fa una per any des del 2000 a l'any actual:

UAB bellaterra[Affiliation] OR (autonom* AND barcelona[Affiliation]) OR (campus autonom* AND barcelona[Affiliation]) OR bellaterra[Affiliation] OR ATONOMA BARCELONA[Affiliation] OR AUTANOMA BARCELONA[Affiliation] OR AUTNOMA BARCELONA[Affiliation] OR AUTOMA BARCELONA[Affiliation] OR AUTOMONA BARCELONA[Affiliation] OR AUTOMOUS BARCELONA[Affiliation] OR AUTONAMA BARCELONA[Affiliation] OR autonoma barcelona OR UAB barcelona[Affiliation]

D'aquests registres es creuen amb la llista de registres que consta que són d'accés obert i que estan a:

https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/pmc/oa_file_list.txt

Agafem també una llista d'equivalències de pmid, dois, etc que està a:

https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/pmc/PMC-ids.csv.gz

Aquesta llista ens serveix per saber si un registre ja el tenim via DOI, però també per afegir-hi el registre pmid de registres que ja tinguem.

Després el registre el recol·lectem via OAI, amb una sintaxi com aquesta:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/oai/oai.cgi?verb=GetRecord&metadataPrefix=pmc&identifier=oai:pubmedcentral.nih.gov:4317171

Per tant, tot i que no és una recol·lecció OAI, se li assembla molt. Crec que val la pena fer-ho, i amb aixó tindrem:

  1. Accés als registres originals via https://ddd.uab.cat/idregistres.py
  2. Ús d'un client OAI especialitzat com Sickle, i d'aquesta manera possiblement solucionar els problemes de diacrítics que tenim darrerament.

Tasques relacionades 1 (0 obertes1 tancada)

relacionat amb DDD - Tasca #6690: Adaptar la recol·lecció automàtica de Pubmed als canvis de desembre del 2021TancadaFerran Jorba10-01-2022Accions
Accions

També disponible a: PDF Atom